Son được sinh ra ở Chuncheon, thuộc tỉnh Gangwon[10]. Cha của anh, ông Son Woong-jung từng là một cầu thủ bóng đá nhà nghề nay đã nghỉ hưu, sau đó ông trở thành huấn luyện viên và cũng đã từng có một khoảng thời gian chơi cho đội B trong màu áo của đội tuyển quốc gia Hàn Quốc.

Ít tháng sau khi chào đời ở Chuncheon, Son theo gia đình chuyển đến định cư ở Canada, rồi sang Pháp trước khi dừng chân ở New Zealand. Vì không có quốc tịch nên bố mẹ đăng ký cho Son theo học dưới dạng trao đổi văn hóa giữa hai nước ở trường Mission Heights. Cho đến năm 9 tuổi, Son mới được quay trở về Hàn Quốc. Tại đây, anh được đưa tới trường trung học Dongbuk và sau đó anh đã bất ngờ tốt nghiệp với tư cách của một thủ khoa.

Nhưng ngay khi bước vào tuổi dậy thì, Son bắt đầu chán học. Anh bắt đầu tìm thấy niềm vui mới thú vị hơn là chuyện đèn sách. Son đam mê bóng đá, và có khao khát trở thành cầu thủ nhà nghề, sang châu Âu thi đấu và kế tục sự nghiệp thành danh của các đàn anh như Park Ji-sung, Ahn Jung-hwan hay thậm chí là huyền thoại sống của bóng đá Hàn Quốc - "Tscha Bum" Cha Bum-kun. Một năm sau ngày vào trường cấp ba, Son ghi danh tại lò đào tạo trẻ FC Seoul, nơi đã phát hiện ra tài năng của Lee Young-Pyo, một cựu tuyển thủ Hàn Quốc từng khoác áo Tottenham. Tuy nhiên, Son khi đó mới chỉ là một cậu bé nhặt bóng trong các trận đấu trên sân nhà của FC Seoul trong năm 2008, khi anh còn là một cầu thủ trẻ của đội. Vào thời điểm đó, hình mẫu của anh là tiền vệ Lee Chung-yong, người từng chơi cho 2 câu lạc bộ khác nhau tại Anh là Crystal Palace và Bolton Wanderers.